Prueba de Southern Blot para Gastroenteritis por Rotavirus Grupo A.

La hidratación Southern blot como sistema de confirmación de la naturaleza del amplímero porque, además, incrementaba la sensibilidad del método de detección molecular. La sonda diseñada "probe VP6" (5´ CAA ATG ATA ACT ATG AAT GG) conjugada con digoxigenina era especifica de una región interna del amplímero y reconocía una región del segmento 6 muy conservada entre los de rotavirus del grupo A conocidos. En primer lugar se transfería el DNA del gel de agarosa a una membrana de nylos, luego se procedía con la hidratación, para finalmente proceder con la revelación.

Fuente:

1. http://bdigital.dgse.uaa.mx:8080/xmlui/handle/11317/1822

 PCR en Gastroenteritis por rotavirus.                                                          

Tema: Conducta terapéutica de los médicos ante el resultado de las pruebas de detección de patógenos en niños con diarrea aguda.

Objetivo: determinar el impacto de herramientas moleculares para detección de patógenos virales y bacterianos en las decisiones terapéuticas antibióticas en diarrea aguda.

Tipos de Muestras: Heces.

Tipo de Ácidos Nucleicos: ADN viral

Extracción de ADN: Disrupción celular (lisis)

Genes a Codificar: VP4        776aa           VP7         326aa

Tipo de PCR: PCR Multiplex.

PASOS                                                              TIEMPO                                                 TEMPERATURA

• Desnaturalización                                 30s                                                                75°C
• Hidratación                                           60s                                                                60°C
• Elongación                                            60s                                                                72°

Visualización: Electroforesis en gel.

Sensibilidad y Especificidad

                                                                   Sensibilidad                                                   Especificidad

Fiebre                                                             67%                                                             46%

Vómitos                                                          78%                                                             41%

Deshidratación                                                 9%                                                              95%

Desnutrición                                                   18%                                                              93%

Fuente:

1. https://www.medigraphic.com/pdfs/pediat/sp-2018/sp181b.pdf

 Alteraciones de la Epigenómica de la Gastroenteritis por rotavirus                  

Como ya conocemos la epigenómica abarca el estudio de los elementos funcionales clave que regulan la expresión génica en una célula. Dentro de estos elementos funcionales encontramos al medio ambiente punto de vital importancia dentro de la gastroenteritis por rotavirus debido a ser transmitido cuando existe una mala higiene el microbioma intestinal tiene una importancia debido a que si existe alguna alteración en ella puede beneficiar a la mutación del virus. Se han encontrado que la falta de eficacia de las vacunas en determinadas poblaciones es debida a que los pacientes son genéticamente resistentes a los virus a partir de los cuales se sintetizaron las vacunas. El trabajo apunta a que los genes FUT2 y FUT3, responsables de producir determinados antígenos en las células del intestino, median la susceptibilidad a la infección por rotavirus sintomática.

Fuente

1. https://www.nature.com/articles/nature18847

2. https://dspace.unl.edu.ec/jspui/bitstream/123456789/22206/3/Valeria%20Michelle%20Ordo%C3%B1ez%20Torres.pdf

 Alteración de la traducción en la Gastroenteritis por Rotavirus                  

Es importante entender que cualquier cambio en el ADN repercutirá en el ARNm llevando a la producción de proteínas que no funcionan. A partir de una duplicación parcial de una secuencia que comienza después del codón stop ORF y se extiende hasta el extre   3´ y da lugar a una región 3´ no traducida que no afecta al producto proteico del segmento. Puede darse delecciones de fragmentos de ARN aunque son raras, la más frecuente se da en el segmento 11 del genoma. Aunque se ha observado este evento en los segmentos 5 a 10. Los virones de triple cada maduros del rotavirus tardan en producirse 10-12 horas y se liberan en grandes cantidades al lumen intestinal, abandonando la células mediante lisis.

Fuente:

1. http://www.microbiologybook.org/Spanish-Virology/spanish-chapter4.htm

2. https://www.news-medical.net/health/Rotavirus-Mechanisms-(Spanish).aspx